¿A que te refieres con cambio arriba?
Si generas el escenario que te comenté poniendo en las líneas de tu pago efectuado la cuenta en lempiras y en medio de pago tu cuenta en dolares, ¿te marca algún error de generación o no cumple con tu objetivo?
En mi caso tengo que especificar que la moneda del documento será USD por que mi moneda local es pesos mexicanos en tu caso solo es cuestión de que juegues con dicho parámetro hasta que logres tu configuración deseada. Si mi imaginación no me falla, tendrías que usar igual USD ya que es la moneda que regirá el pago y al final de cuentas a tu cuenta ingresarán lempiras porqué es su moneda de la cuenta.
Te recomiendo trabajes en una base de pruebas y generes cuanta prueba se te ocurra, a veces para solucionar un problema no hay de otra más que jugar con los parámetros de los documentos.
Saludos.